47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3019 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1211    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  37.09 
 
 		 750 aa  194  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  36.42 
 
 		 640 aa  191  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  35.96 
 
 		 680 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  47.3 
 
 		 918 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  42.32 
 
 		 339 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  37.29 
 
 		 936 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  40.56 
 
 		 355 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  48.09 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  41.88 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  44.58 
 
 		 480 aa  144  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  39.66 
 
 		 633 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  50.23 
 
 		 374 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  46.54 
 
 		 753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  49.01 
 
 		 321 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  50 
 
 		 350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  51.7 
 
 		 365 aa  127  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  45.74 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  42.91 
 
 		 277 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  42.51 
 
 		 277 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  42.51 
 
 		 277 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  45.91 
 
 		 675 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  43.26 
 
 		 654 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1079 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  36.24 
 
 		 621 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  46.84 
 
 		 341 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  49.01 
 
 		 250 aa  112  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  44.6 
 
 		 305 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  50.27 
 
 		 286 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  34.03 
 
 		 591 aa  100  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  37.66 
 
 		 543 aa  99.8  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  37.33 
 
 		 274 aa  99.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  52.55 
 
 		 200 aa  92  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  45.81 
 
 		 227 aa  90.5  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  35.82 
 
 		 1131 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  39.19 
 
 		 971 aa  89  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  46.5 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0896  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.55 
 
 		 234 aa  49.7  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.323909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  37.11 
 
 		 689 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  34.93 
 
 		 985 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3171  pseudouridine synthase, Rsu  32.87 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.601748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.06 
 
 		 2914 aa  46.2  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  31.09 
 
 		 1161 aa  45.8  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  22.73 
 
 		 2851 aa  45.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0907  pseudouridine synthase Rsu  34.2 
 
 		 743 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0835  hypothetical protein  20.39 
 
 		 264 aa  44.3  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  35.47 
 
 		 698 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.575781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>