47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3800 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1179    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1512  hypothetical protein  43.61 
 
 		 640 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000167269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1513  hypothetical protein  39.06 
 
 		 680 aa  259  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6067  hypothetical protein  40.79 
 
 		 936 aa  247  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2161  hypothetical protein  50.2 
 
 		 355 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2020  hypothetical protein  52.12 
 
 		 480 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1906  tetratricopeptide TPR_4  54.19 
 
 		 753 aa  218  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.346521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5444  hypothetical protein  50.46 
 
 		 918 aa  217  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2042  hypothetical protein  49.35 
 
 		 349 aa  216  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13630  hypothetical protein  44.41 
 
 		 621 aa  210  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25500  hypothetical protein  46.4 
 
 		 339 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  41.71 
 
 		 750 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3512  hypothetical protein  47.87 
 
 		 305 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.804632  normal  0.14913 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1337  hypothetical protein  50.8 
 
 		 788 aa  195  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1253  tetratricopeptide TPR_4  47.35 
 
 		 350 aa  193  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3293  hypothetical protein  48.56 
 
 		 285 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5461  hypothetical protein  52.68 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0553967  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11707  hypothetical protein  52.89 
 
 		 250 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.104662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1121  hypothetical protein  38.78 
 
 		 618 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.642413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2969  hypothetical protein  45.15 
 
 		 277 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2998  hypothetical protein  45.15 
 
 		 277 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.631181  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2954  hypothetical protein  45.15 
 
 		 277 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1981  tetratricopeptide TPR_2  51.38 
 
 		 321 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1897  tetratricopeptide TPR_4  54.9 
 
 		 286 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4444  Tetratricopeptide TPR_4  44.21 
 
 		 365 aa  173  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.457658  normal  0.0435915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2830  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  47.95 
 
 		 675 aa  173  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1746  hypothetical protein  42.38 
 
 		 1079 aa  170  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3166  tetratricopeptide TPR_2  44.6 
 
 		 654 aa  165  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307175  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07420  hypothetical protein  40.91 
 
 		 274 aa  160  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.704818  normal  0.126809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3039  hypothetical protein  49.43 
 
 		 227 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.635634  normal  0.640764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4077  hypothetical protein  50 
 
 		 374 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313284  hitchhiker  0.00876664 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0801  hypothetical protein  34.77 
 
 		 591 aa  134  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0753536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3019  hypothetical protein  39.74 
 
 		 658 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.882061  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0677  hypothetical protein  32.99 
 
 		 543 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2386  hypothetical protein  52.06 
 
 		 200 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2360  hypothetical protein  50.99 
 
 		 245 aa  94.4  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0182213  hitchhiker  0.00536835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  43.35 
 
 		 1131 aa  71.2  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  43.51 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  39.23 
 
 		 736 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1275  RNA-binding S4 domain protein  39.09 
 
 		 674 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.206781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3676  BigA  40.48 
 
 		 1940 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3785  porin autotransporter  45.16 
 
 		 1941 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3847  porin, autotransporter  43.55 
 
 		 1923 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0629  lipoprotein (VmcE)  26.19 
 
 		 215 aa  45.1  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0157235  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1432  pseudouridine synthase, Rsu  35.89 
 
 		 610 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3863  pseudouridine synthase, Rsu  35.98 
 
 		 680 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.695211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1401  hypothetical protein  34.91 
 
 		 631 aa  43.9  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>