54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4750 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  66.1 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  46.1 
 
 		 437 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  44.87 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  54.28 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  48.49 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  45.07 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  40.79 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  41.69 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  70.45 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  71.43 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  75.76 
 
 		 231 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  80.3 
 
 		 261 aa  113  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  80.3 
 
 		 263 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  75.38 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  67.06 
 
 		 219 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  73.85 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  74.63 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  74.63 
 
 		 252 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  58 
 
 		 231 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  58.42 
 
 		 240 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  61.8 
 
 		 241 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  78.69 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  57.5 
 
 		 248 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  67.24 
 
 		 216 aa  89.4  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  51.09 
 
 		 144 aa  85.9  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  62.32 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  51.25 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  55.22 
 
 		 143 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  50.62 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  44.87 
 
 		 203 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  45 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  51.61 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  51.67 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  51.67 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  52.63 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  38.46 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  42.86 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  58.73 
 
 		 718 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.85 
 
 		 712 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 717 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  43.14 
 
 		 273 aa  52.8  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  40.72 
 
 		 723 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  41.38 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  54.29 
 
 		 709 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  54.29 
 
 		 688 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  19.9 
 
 		 2449 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2891  5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase-like protein  53.85 
 
 		 625 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.386248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1913  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1198 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0476202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9251  hypothetical protein  45.76 
 
 		 651 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  47.62 
 
 		 674 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  33.33 
 
 		 789 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  50.75 
 
 		 656 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  35.53 
 
 		 897 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>