41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2500 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  66.29 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  60.71 
 
 		 252 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  58.28 
 
 		 275 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  61.11 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  83.84 
 
 		 294 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  60.43 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  53.09 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  72.41 
 
 		 345 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  69.77 
 
 		 345 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  74.65 
 
 		 347 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  74.65 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  65.56 
 
 		 437 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  64.44 
 
 		 425 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  68.82 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  74.63 
 
 		 431 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  71.21 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  71.01 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  73.44 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  73.02 
 
 		 401 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  67.03 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  73.02 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  73.02 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  73.02 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  53.93 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  48.15 
 
 		 144 aa  99.4  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  54.35 
 
 		 373 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  47.25 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  55.06 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  51.22 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  51.22 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  50.65 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  50 
 
 		 262 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  59.38 
 
 		 249 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  55.26 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  51.81 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  46.91 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  55.38 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  45.88 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  45.45 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  45.45 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>