55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7607 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  59.18 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  61.7 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  59.07 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  53.79 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  55.31 
 
 		 231 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  75 
 
 		 240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  48.28 
 
 		 401 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  73.49 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  42.73 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  67.9 
 
 		 437 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  71.95 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  66.67 
 
 		 425 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  73.91 
 
 		 347 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  75.38 
 
 		 431 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  73.91 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  70.59 
 
 		 350 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  65.17 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  53.45 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  53.15 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  71.88 
 
 		 219 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  70.77 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  70.77 
 
 		 244 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  55.21 
 
 		 144 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  58.14 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  68.18 
 
 		 263 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  53.93 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  58.06 
 
 		 216 aa  85.5  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  49.41 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  46.81 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  59.65 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  54.41 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  54.41 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  54.41 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  58.73 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  36.32 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  48 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  43.01 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  57.53 
 
 		 1053 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  35 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  60 
 
 		 1059 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  40.3 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2802  ribonuclease E  70.45 
 
 		 1088 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000361809  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2918  ribonuclease E  54.69 
 
 		 1085 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000100731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  66 
 
 		 1088 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0520  ribonuclease E  53.97 
 
 		 1090 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2491  ribonuclease E  53.97 
 
 		 1090 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000172006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2791  ribonuclease E  53.97 
 
 		 1087 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000882056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1814  ribonuclease E  53.97 
 
 		 1087 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0112079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  70 
 
 		 1101 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  76.32 
 
 		 669 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  68.29 
 
 		 1096 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2598  cation diffusion facilitator family transporter  62.16 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2922  ribonuclease, Rne/Rng family  69.05 
 
 		 1097 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000705961  normal  0.54344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>