17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9251 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9251  hypothetical protein  100 
 
 		 651 aa  1274    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  29.93 
 
 		 2449 aa  82  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  39.42 
 
 		 674 aa  60.1  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  40.37 
 
 		 688 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1733  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.41 
 
 		 712 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.555065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  41.24 
 
 		 709 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  41.11 
 
 		 501 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 723 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  24.03 
 
 		 2397 aa  48.5  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3183  PSP1 domain protein  45.31 
 
 		 423 aa  47.4  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  42.47 
 
 		 347 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0739  hypothetical protein  36.92 
 
 		 251 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4749  OmpA/MotB domain-containing protein  37.08 
 
 		 717 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0350948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.71 
 
 		 592 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  41.67 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5291  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 718 aa  43.9  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.550755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.84 
 
 		 2272 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>