98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3983 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  95.58 
 
 		 397 aa  751    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 		 399 aa  808    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  79.79 
 
 		 398 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  78.76 
 
 		 398 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  77.6 
 
 		 406 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  78.88 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  77.6 
 
 		 406 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  77.34 
 
 		 406 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  74.61 
 
 		 398 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  74.35 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  72.52 
 
 		 399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  73.23 
 
 		 399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  72.97 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  73.23 
 
 		 399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  73.23 
 
 		 399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  72.7 
 
 		 399 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  38.29 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  32.48 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  33.33 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  31.97 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  30.95 
 
 		 393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  26.77 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.13 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.87 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  28.57 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  28.42 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  27.71 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  25.06 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  27.57 
 
 		 412 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  27.81 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  24.19 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  29.51 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  27.44 
 
 		 388 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  27.44 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25.54 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  26.13 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  27.58 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  27.56 
 
 		 412 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  27.3 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  26.92 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  26.92 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  26.92 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  23.48 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  24.62 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  25.89 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  26.03 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  26.03 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  27.3 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  26.42 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  26.15 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  27.03 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  25.32 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  26.51 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  27.82 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  26.67 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  25.13 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  27.02 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.35 
 
 		 393 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.72 
 
 		 441 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  28.2 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.38 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  24.87 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  24.94 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  24.06 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  22.11 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  24.24 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  23.48 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  23.43 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  22.26 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  23.23 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  25.83 
 
 		 395 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  22.78 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  24.11 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  24.11 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  24.11 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  22.92 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  24.47 
 
 		 531 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  25 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  22.31 
 
 		 397 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0896  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.86 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.323909  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  23.06 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  21.27 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  28.39 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  21.11 
 
 		 396 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>