115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0115 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  100 
 
 		 391 aa  793    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  33.25 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  30.9 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  29.87 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  29.92 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  29.97 
 
 		 441 aa  135  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  31.28 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  27.32 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  27.55 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  27.05 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  27.3 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  26.5 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  26.79 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  28.64 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  30.91 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  26.21 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  30.91 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  27.4 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  30.77 
 
 		 415 aa  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  30.24 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  26.46 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  26.46 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  26.46 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  26.46 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  27.61 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  27.61 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  27.61 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  30.8 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  26.09 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  27.89 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  27.37 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  29.28 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  28.66 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  26.61 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  27.46 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  27.46 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  26.75 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  26.84 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  26.52 
 
 		 412 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  23.8 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  23.08 
 
 		 393 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  23.81 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  23.81 
 
 		 397 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  24.43 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  24.43 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  24.16 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  25.38 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  23.37 
 
 		 398 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  23.8 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  23.91 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  24.62 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  23.91 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  23.91 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  26.67 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  25.45 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  25.99 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  23.91 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  23.91 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  22.83 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  27.3 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  24.32 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  26.33 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  23.86 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.87 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  23.97 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  24.69 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  23.56 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  25.95 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  22.53 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  20.76 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  25.25 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  24.92 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  26.04 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  21.97 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  23.28 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  25 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  25 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  21.39 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  22.25 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  23.28 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  23.29 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  23.24 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  22.25 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  21.98 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  24.59 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  23.4 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  22.59 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  23.44 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>