105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3062 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  100 
 
 
424 aa  857    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  37.43 
 
 
427 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  34.96 
 
 
392 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  34.69 
 
 
392 aa  206  9e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  32.62 
 
 
395 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  32.35 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  35.12 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  35.83 
 
 
390 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  29.83 
 
 
409 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  33.69 
 
 
412 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  33.15 
 
 
412 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 
403 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  36.04 
 
 
413 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  30.9 
 
 
391 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  33.09 
 
 
410 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  31.83 
 
 
412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  36.08 
 
 
412 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  35.76 
 
 
412 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  35.76 
 
 
412 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  33.42 
 
 
415 aa  150  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  31.05 
 
 
414 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  34.49 
 
 
412 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  32.23 
 
 
441 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  30.92 
 
 
393 aa  144  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  27.32 
 
 
435 aa  140  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  30.79 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  28.64 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  27.16 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  26.1 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  26.84 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  28.27 
 
 
398 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  29.07 
 
 
390 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  29.21 
 
 
404 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  23.78 
 
 
396 aa  114  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  25.54 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  25.74 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  25.74 
 
 
406 aa  111  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  25.47 
 
 
406 aa  110  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  24.66 
 
 
398 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  24.66 
 
 
398 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  25.57 
 
 
398 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  27.39 
 
 
394 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  26.02 
 
 
397 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  25.66 
 
 
398 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  26.92 
 
 
397 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  25 
 
 
396 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  23.81 
 
 
399 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  24.74 
 
 
399 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  24.74 
 
 
399 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  24.74 
 
 
399 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  24.74 
 
 
399 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  24.74 
 
 
399 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  24.17 
 
 
400 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  22.22 
 
 
391 aa  97.1  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  27.73 
 
 
397 aa  96.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  25.34 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  35.02 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  36.82 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  36.82 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  32.81 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  32.81 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  25.13 
 
 
388 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  30.09 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  29.48 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  29.07 
 
 
388 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  31.02 
 
 
388 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  29.31 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  23.06 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  31.73 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  26.2 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  25.3 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  26.48 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  22.56 
 
 
425 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  23.65 
 
 
396 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  25.08 
 
 
391 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  24.1 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  25 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  23.35 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  25.27 
 
 
396 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  25.31 
 
 
418 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  26.94 
 
 
397 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  29.22 
 
 
389 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  23.05 
 
 
396 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  24.93 
 
 
389 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  25 
 
 
395 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  25 
 
 
395 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  25 
 
 
395 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  24.73 
 
 
396 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>