111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0026 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  100 
 
 
390 aa  758    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  40.61 
 
 
427 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  38.36 
 
 
395 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  38.11 
 
 
395 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  39.78 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  39.51 
 
 
392 aa  220  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  37.63 
 
 
412 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  37.94 
 
 
414 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  36.1 
 
 
424 aa  205  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  36.9 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
403 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  40 
 
 
414 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  38.58 
 
 
409 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  39.19 
 
 
412 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  37.53 
 
 
412 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  38.92 
 
 
412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  41.88 
 
 
412 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  39.34 
 
 
415 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  42.21 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  30 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  38.34 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  32.56 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  41.23 
 
 
413 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  37.82 
 
 
410 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  36.46 
 
 
435 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  31.85 
 
 
393 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  30.71 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  30.75 
 
 
393 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  30.13 
 
 
399 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  33.17 
 
 
404 aa  143  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  29.75 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  31.19 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  30.28 
 
 
393 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  30.75 
 
 
406 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  30.75 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  29.23 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  29.23 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  29.14 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  30.48 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  29.23 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  27.6 
 
 
399 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  29.56 
 
 
395 aa  133  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  28.27 
 
 
398 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  30.08 
 
 
396 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  29.22 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  28.28 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  29.31 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  29.02 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  28.53 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  29.85 
 
 
396 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  28.16 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  28.26 
 
 
399 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  28.26 
 
 
399 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  32.82 
 
 
397 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  34.27 
 
 
390 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  29.12 
 
 
395 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  29.12 
 
 
395 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  29.24 
 
 
396 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  29.24 
 
 
396 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  29.24 
 
 
396 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  29.24 
 
 
396 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  29.24 
 
 
396 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  29.24 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  29.24 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  27.76 
 
 
396 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  29.38 
 
 
397 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  29.14 
 
 
397 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  27.18 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  27.37 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  25.74 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  25.81 
 
 
396 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  28.82 
 
 
396 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  28.02 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  27.18 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  24.68 
 
 
391 aa  93.2  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.06 
 
 
393 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  25.89 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  25.89 
 
 
388 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  26.2 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  26.52 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  27.8 
 
 
389 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  29.35 
 
 
397 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  25.96 
 
 
389 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  28.64 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  27.59 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  27.94 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0129  HemY domain protein  31.13 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  25.83 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  25.06 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  24.93 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.912703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>