85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2466 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  95.19 
 
 		 395 aa  690    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  96.46 
 
 		 395 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 395 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  99.75 
 
 		 395 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  96.46 
 
 		 395 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  85.35 
 
 		 396 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  96.96 
 
 		 395 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  85.86 
 
 		 396 aa  644    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  96.46 
 
 		 395 aa  704    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  76.52 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  77.02 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  76.52 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  52.42 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  48.85 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  49.36 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  53.94 
 
 		 396 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  51.15 
 
 		 397 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  40.25 
 
 		 394 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  36.41 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  33.59 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  35.57 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  34.09 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  32.2 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  31.23 
 
 		 415 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  30.17 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  32.41 
 
 		 412 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  31.97 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  32.28 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  29.04 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  30.05 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  29.53 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  31.65 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  29.85 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  26.67 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  31.63 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  25.97 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  31.37 
 
 		 390 aa  99.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  28.71 
 
 		 407 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  29.4 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  33.33 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  32.68 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  27.64 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  32.68 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.43 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.43 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  33.01 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  25.27 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  25 
 
 		 392 aa  86.3  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  31.75 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  28.79 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  28.86 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  30.22 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  28.87 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25.47 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  23.38 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  23.1 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  23.74 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  24.34 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  30.65 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  24.34 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  25.08 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  24.34 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  24.19 
 
 		 396 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  25.63 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  26.5 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  25.88 
 
 		 388 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  24.48 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  28.77 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  25.88 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  26.13 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  26.13 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  24.25 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  26.47 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  25.4 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  27.92 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  27.66 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  24.44 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  27.54 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>