108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6003 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  97.82 
 
 
412 aa  710    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  100 
 
 
412 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  55.72 
 
 
412 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  56.86 
 
 
414 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  56.34 
 
 
414 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  56.05 
 
 
410 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  55.9 
 
 
415 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  54.05 
 
 
412 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  53.56 
 
 
412 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  54.05 
 
 
412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  54.05 
 
 
412 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  40.63 
 
 
413 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  38.42 
 
 
409 aa  213  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  32.92 
 
 
395 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  32.43 
 
 
395 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
403 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  33.92 
 
 
427 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  31.48 
 
 
409 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  38.4 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  33.87 
 
 
424 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  32.19 
 
 
392 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  31.93 
 
 
392 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  31.31 
 
 
391 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  31.83 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  29.2 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  27.13 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  29.34 
 
 
393 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  27.96 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  30.89 
 
 
394 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  28.36 
 
 
393 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  28.22 
 
 
393 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  26.36 
 
 
397 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  29.56 
 
 
404 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  28.89 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  27.06 
 
 
406 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  28.82 
 
 
393 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  29.24 
 
 
435 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  27.06 
 
 
406 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  25.84 
 
 
399 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  26.8 
 
 
406 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  25.26 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  25.32 
 
 
398 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  25.71 
 
 
398 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  26.61 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  26.61 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  26.55 
 
 
399 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  26.61 
 
 
399 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  26.61 
 
 
399 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  29.44 
 
 
396 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  26.3 
 
 
396 aa  106  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  28.86 
 
 
388 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  28.04 
 
 
388 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  32.13 
 
 
390 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  29.2 
 
 
396 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  26.58 
 
 
395 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  26.58 
 
 
395 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  26.58 
 
 
395 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  27.79 
 
 
388 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  28.72 
 
 
389 aa  103  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  27.79 
 
 
388 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  26.34 
 
 
425 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  28.03 
 
 
395 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  29.34 
 
 
388 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  28.28 
 
 
395 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  28.03 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  27.09 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  29.83 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  28.78 
 
 
396 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  28.78 
 
 
396 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  27.34 
 
 
389 aa  96.3  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  28.79 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  28.39 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  28.54 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  28.54 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  28.54 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  28.54 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  28.54 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  27.56 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  28.57 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  29.58 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  29.58 
 
 
388 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  31.15 
 
 
388 aa  93.2  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  24.94 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.77 
 
 
393 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  27.92 
 
 
397 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  28.12 
 
 
397 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  29.35 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  28.12 
 
 
397 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  29.14 
 
 
389 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  29.57 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  27.48 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  27.11 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  25.07 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>