81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2569 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  96.98 
 
 		 397 aa  776    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  100 
 
 		 397 aa  797    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  90.43 
 
 		 397 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  69.11 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  69.87 
 
 		 396 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  50.38 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  49.62 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  49.36 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  49.36 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  49.36 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  49.36 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  49.36 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  49.36 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  49.36 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  49.36 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  49.36 
 
 		 396 aa  342  8e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  49.36 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  49.36 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  49.87 
 
 		 395 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  48.85 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  49.62 
 
 		 395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  49.11 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  49.11 
 
 		 395 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  37.06 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  34.55 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  34.57 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  33.67 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  31.17 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  32.02 
 
 		 415 aa  136  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  31.67 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  30.4 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  30.88 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  30.03 
 
 		 427 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  30.45 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  27.59 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  26.8 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  28.7 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  29.21 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  28.74 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  31.88 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  23.81 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  28.42 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  28.78 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  30.6 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  24.39 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  31.52 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  31.16 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  31.16 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  25.34 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.99 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.99 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  29.18 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  31.16 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  26.65 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  26.2 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  29.9 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  24.8 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  22.97 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  22.7 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.14 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  28.14 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  28.12 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  27.35 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  27.6 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  22.01 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  22.34 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  21.29 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  21.73 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  21.73 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  21.73 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  21.8 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  32.79 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>