44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1377 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  100 
 
 		 427 aa  823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  61.95 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  61.58 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  62.86 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  59.37 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  56.45 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  58.94 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  55.01 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  60.53 
 
 		 431 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  45.78 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  42.93 
 
 		 415 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  30.84 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  30.84 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  30.84 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  31.48 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  31.48 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  30.5 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  31.25 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  30.57 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  29.86 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  31.02 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  30.25 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  30.32 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  30.84 
 
 		 394 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  30.72 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  28.3 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  27.71 
 
 		 396 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  27.32 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  35.14 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  35.14 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  28.13 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  34.23 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  34.23 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  24.88 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  29.65 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  29.65 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  29.65 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  23.1 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  25.41 
 
 		 390 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>