97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3409 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  89.9 
 
 		 396 aa  700    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  97.22 
 
 		 396 aa  747    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  75.51 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  75.51 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  75.51 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  75.51 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  75.51 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  75.76 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  75.25 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  75.25 
 
 		 396 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  77.27 
 
 		 395 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  76.01 
 
 		 395 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  76.01 
 
 		 395 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  76.01 
 
 		 395 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  76.52 
 
 		 395 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  76.26 
 
 		 395 aa  547  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  75.76 
 
 		 395 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  50.38 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  50.38 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  51.91 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  51.65 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  51.91 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  40 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  35.38 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  31.11 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  34.58 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  31.04 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  33.01 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  32.32 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  31.39 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  31.44 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  26.79 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  30.6 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  29.36 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  26.1 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.84 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  28.93 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  32.64 
 
 		 414 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  24.3 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  29.64 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  30.65 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  29.02 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  28.15 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  31.03 
 
 		 435 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  29.78 
 
 		 390 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  31.65 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  28.2 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  26.18 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  34.02 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  29.95 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  33.47 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  24.18 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  33.2 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  23.91 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  33.61 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  31.48 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  25 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  28.4 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  23.02 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  28.99 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  23.6 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  25.2 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  28.76 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  24.44 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  23.35 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  24.65 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  24.12 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  24.12 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  23.87 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  25.4 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  28.08 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  25.19 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  25.19 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  25.19 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  23.5 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  23.53 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  23.58 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  22.03 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  22.03 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  22.03 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  22.43 
 
 		 389 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  22.28 
 
 		 391 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  23.73 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  22.22 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  28.34 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  24.38 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 595 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  20.2 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  20.2 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>