117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0189 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  100 
 
 		 412 aa  796    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  99.27 
 
 		 412 aa  793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  97.09 
 
 		 412 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  93.69 
 
 		 412 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  77.18 
 
 		 412 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  73.19 
 
 		 414 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  72.62 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  63.89 
 
 		 415 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  54.05 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  53.32 
 
 		 412 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  52.76 
 
 		 410 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  35.17 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  33.82 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  39.47 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  38.38 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  37.84 
 
 		 409 aa  209  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  32.75 
 
 		 395 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  32.75 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  33.87 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  33.6 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  34.39 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  33.17 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  30.35 
 
 		 398 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  31.01 
 
 		 435 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  30.07 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  29.87 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  28.5 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  30.15 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  28.13 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  26.49 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  25.07 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  27.82 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  26.75 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  27.56 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  27.56 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  26.1 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  29.02 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  27.54 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  29.02 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  29.02 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  29.02 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  25.63 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  29.02 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  30.94 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  31 
 
 		 395 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  31 
 
 		 395 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  31 
 
 		 395 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  30.06 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  29.49 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  28.93 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  25.71 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  29.95 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  27.39 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  29.95 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  29.15 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  29.7 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  29.7 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  29.7 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  29.7 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  29.7 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  29.72 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  29.59 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  29.34 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  29.7 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  26.6 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  28.89 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  33.74 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  36.92 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  28.18 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  27.27 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  28.25 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  27.27 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  28.1 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  25.43 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  30.53 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  26.78 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  27.97 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  24.35 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  27.98 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  27.49 
 
 		 388 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  27.85 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  27.85 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  29.11 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  25.33 
 
 		 391 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.06 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  27.32 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  27.49 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  25.51 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  24.81 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  29.35 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  26.93 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>