63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1135 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  786    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  96.93 
 
 
391 aa  702    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  55.15 
 
 
418 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0129  HemY domain protein  41.9 
 
 
431 aa  268  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  25.99 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  27.8 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  28.85 
 
 
427 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  27.53 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  24.6 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  28.44 
 
 
412 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  28.16 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  28.13 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.01 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25.34 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  25 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.96 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.71 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  29.61 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  27.78 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  27.78 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  25.4 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  24.42 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  23.3 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  23.58 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  23.01 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  29.25 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  31.61 
 
 
390 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  26.79 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  29.85 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  29.85 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  28.57 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  29.85 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  28.57 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  28.57 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  27.97 
 
 
412 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  27.44 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  22.86 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  20.62 
 
 
409 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  29.46 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  29.46 
 
 
396 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  28.23 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  26.34 
 
 
393 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  28.68 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  28.68 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  28.68 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  28.68 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  28.68 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  32.38 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  28.68 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  24.76 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  26.99 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  28.24 
 
 
397 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  26.32 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  29.01 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  20.97 
 
 
397 aa  46.6  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.57 
 
 
575 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  26.32 
 
 
590 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
556 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 
586 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  19.02 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  27.11 
 
 
520 aa  43.9  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  27.48 
 
 
396 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>