118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0214 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  97.09 
 
 		 412 aa  679    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  96.36 
 
 		 412 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 412 aa  797    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  93.93 
 
 		 412 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  77.64 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  73.19 
 
 		 414 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  73.11 
 
 		 414 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  63.89 
 
 		 415 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  54.05 
 
 		 412 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  53.32 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  53.27 
 
 		 410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  33.82 
 
 		 409 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 		 403 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  39.23 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  38.08 
 
 		 409 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  38.92 
 
 		 390 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  33.5 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  33.5 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  34.13 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  33.87 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  34.66 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  33.57 
 
 		 427 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  30.17 
 
 		 398 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  30.56 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  30.75 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  29 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  30.13 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  30.65 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  27.37 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  28.02 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  27.03 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  26.19 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  28.29 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  28.85 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  24.87 
 
 		 399 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  26.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  25.58 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  24.87 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  29.43 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  29.85 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  26.18 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  30.62 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  26.18 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  26.44 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  26.18 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  27.98 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  30.06 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  26.99 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  30 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  30 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  30 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  30.65 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  30.65 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  29.34 
 
 		 396 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  30.65 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  29.08 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  30.4 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  30.4 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  30.4 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  30.4 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  30.4 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  27.58 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  29.5 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  26.83 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  34.55 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  28.14 
 
 		 395 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  28.14 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  26.87 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  35.9 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  27.43 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  27.23 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  27.23 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  28.57 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  28.5 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  27.82 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  30.88 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  27.86 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  25 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  26.73 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  30.41 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  28.32 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  28.32 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  30.13 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  27.44 
 
 		 388 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.25 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  25.07 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  27.7 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  27.32 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  25.06 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  25.51 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  28.67 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  22.41 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>