92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4217 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  99.5 
 
 
399 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  99.25 
 
 
399 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  99.75 
 
 
399 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  99.5 
 
 
399 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 
399 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  95.87 
 
 
398 aa  762    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  95.35 
 
 
398 aa  758    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  86.68 
 
 
399 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  95.61 
 
 
398 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  73.04 
 
 
399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  72.59 
 
 
397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  71.73 
 
 
397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  72.14 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  69.11 
 
 
406 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  69.37 
 
 
406 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  69.11 
 
 
406 aa  557  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  69.37 
 
 
398 aa  544  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  37.78 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  35.01 
 
 
398 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  34.41 
 
 
393 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  33.92 
 
 
393 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  31.65 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  27.15 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.75 
 
 
395 aa  139  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.75 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  31.6 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  30.65 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  32.18 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  26.1 
 
 
409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  32.18 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  26.37 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  28.53 
 
 
390 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  31.55 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  25.82 
 
 
391 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  24.93 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  27.04 
 
 
410 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  26.29 
 
 
393 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  26.57 
 
 
412 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  23.21 
 
 
403 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  30.6 
 
 
388 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  27.08 
 
 
388 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  24.69 
 
 
427 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  25.48 
 
 
392 aa  105  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  25.48 
 
 
392 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  30.41 
 
 
388 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  30.28 
 
 
388 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  30.28 
 
 
388 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  27.84 
 
 
415 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  30.63 
 
 
389 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  27.57 
 
 
412 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  30.13 
 
 
412 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  25.45 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  29.8 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  26.17 
 
 
412 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  31.13 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  27.6 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  25.69 
 
 
388 aa  94.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.06 
 
 
396 aa  94  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  26.08 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  25.4 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  31.97 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  31.27 
 
 
389 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  23.66 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  25.32 
 
 
435 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  28.67 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.84 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  25.98 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  28.38 
 
 
531 aa  60.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  22.89 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  21.64 
 
 
403 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  21.47 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  24.83 
 
 
492 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
1737 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  25.98 
 
 
400 aa  46.6  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 
1486 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  20.92 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  23.2 
 
 
394 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  29 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>