90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0175 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  78.96 
 
 		 406 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  78.76 
 
 		 399 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 		 398 aa  808    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  79.22 
 
 		 406 aa  651    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  79.48 
 
 		 406 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  79.11 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  73.99 
 
 		 399 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  73.18 
 
 		 398 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  72.92 
 
 		 398 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  72.52 
 
 		 397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  71.47 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  72.32 
 
 		 399 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  72.32 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  72.32 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  71.8 
 
 		 399 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  72.06 
 
 		 399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  41.31 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  35.18 
 
 		 398 aa  226  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  33.91 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  33.67 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  32.23 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  29.21 
 
 		 396 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  26.08 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  25.7 
 
 		 395 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  27.82 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  25.06 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  29.67 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  26.38 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  27.6 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  26.6 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  27.89 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  28.15 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  26.14 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  26.28 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  26.45 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  26.28 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  24.05 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  25.4 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  25.38 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  25.48 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  26.92 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  25.38 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  25.38 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  26.51 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  25.48 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  25.77 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  26.5 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  26.79 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  27.46 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  25.38 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.99 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  27.56 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  26.51 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  25.86 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  25.69 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  23.9 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  25.98 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  26.67 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  30.83 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  27.97 
 
 		 388 aa  89.7  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  29.28 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  24.08 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  25.43 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  24.19 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  25.28 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  23.19 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  24.86 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  22.83 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  26.22 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  24.47 
 
 		 531 aa  51.2  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 		 521 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.518556  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  21.67 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  21.36 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  25.74 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  21.78 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  22.97 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  23.95 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  23.95 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  23.95 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  21.23 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  22.69 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  29.3 
 
 		 511 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>