77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2355 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  90.43 
 
 		 397 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  100 
 
 		 397 aa  793    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  91.18 
 
 		 397 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  70.63 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  67.09 
 
 		 396 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  51.65 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  51.15 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  50.64 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  51.91 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  51.91 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  51.91 
 
 		 395 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  52.93 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  50.64 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  50.13 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  52.16 
 
 		 395 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  51.4 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  51.4 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  36.82 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  34.83 
 
 		 393 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  32.35 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  33.42 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  33.25 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  30.92 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  32.24 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  30.9 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  30.17 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  31.44 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  27.05 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  28.5 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  30.36 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  28.93 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  30.9 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  32.12 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  29.55 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  23.55 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  31.92 
 
 		 431 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  27.92 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  28.34 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  22.61 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.86 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  30.8 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  31.41 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  31.41 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.06 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25.35 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  26.42 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.79 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  30.43 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  28.93 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  30.99 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  30.16 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  23.99 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  24.69 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  29.37 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  26.13 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  23.19 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  26.46 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  24.1 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  24.1 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  24.1 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  25.8 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  22.71 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>