99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1232 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  99.75 
 
 
396 aa  771    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  97.22 
 
 
396 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  86.36 
 
 
395 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  100 
 
 
396 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  99.75 
 
 
396 aa  771    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  86.36 
 
 
395 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  99.75 
 
 
396 aa  771    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  99.75 
 
 
396 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  100 
 
 
396 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  86.36 
 
 
395 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  99.75 
 
 
396 aa  771    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  84.34 
 
 
395 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  83.84 
 
 
395 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  83.33 
 
 
395 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2332  HemY domain-containing protein  83.33 
 
 
395 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30446  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  76.01 
 
 
396 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  74.49 
 
 
396 aa  597  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  75.25 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  49.62 
 
 
397 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  49.36 
 
 
397 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  49.87 
 
 
396 aa  355  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2355  putative protein porphyrin biosynthesis  50.64 
 
 
397 aa  349  5e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.354187  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  51.15 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  38.48 
 
 
394 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  35.29 
 
 
404 aa  189  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  33.68 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1440  HemY domain protein  34.83 
 
 
397 aa  177  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0767  HemY domain-containing protein  34.59 
 
 
415 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1996  HemY domain-containing protein  34.29 
 
 
425 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.749547  hitchhiker  0.000309488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3661  putative porphyrin biosynthesis related protein  31.03 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2999  putative porphyrin biosynthesis-related protein  30.95 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.388807  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2565  putative protein porphyrin biosynthesis  30.75 
 
 
390 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1377  HemY domain protein  30.48 
 
 
427 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.256451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  27.53 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  29.67 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  31.49 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  30.91 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  25.06 
 
 
427 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3087  HemY domain-containing protein  28.34 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.676454  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2893  HemY domain-containing protein  29.47 
 
 
427 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257354  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  25.06 
 
 
409 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2380  HemY domain-containing protein  28.75 
 
 
407 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2229  HemY domain-containing protein  30.62 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0303881  normal  0.0116936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  29.46 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  27.13 
 
 
392 aa  93.6  5e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  27.84 
 
 
441 aa  93.2  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.43 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  26.87 
 
 
392 aa  92.8  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.17 
 
 
395 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1037  HemY domain-containing protein  30.94 
 
 
431 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.203765  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  29.97 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1718  hypothetical protein  27.55 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  33.75 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  33.33 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  32.08 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  32.92 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 
403 aa  84  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  26.02 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  27.36 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  24.1 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  23.99 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  27.11 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  25 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  24.93 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  25.4 
 
 
435 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  25.73 
 
 
388 aa  63.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.78 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  25.31 
 
 
388 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  25.38 
 
 
388 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  25.63 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  28.57 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  25.33 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  22.52 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  24.94 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  22.22 
 
 
406 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  22.52 
 
 
406 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  24.94 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  24.94 
 
 
388 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  24.09 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  24.63 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  24.66 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  23.63 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  23.33 
 
 
388 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
595 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  23.96 
 
 
399 aa  47  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  25.54 
 
 
388 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  24.03 
 
 
398 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  24.03 
 
 
398 aa  47  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  25.06 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1228  porphyrin biosynthesis protein  31.11 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  24.21 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1135  HemY domain-containing protein  29.46 
 
 
389 aa  43.1  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>