86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4261 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  95.85 
 
 		 399 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  88.44 
 
 		 399 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  100 
 
 		 398 aa  807    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 		 398 aa  807    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 		 398 aa  807    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  99.75 
 
 		 398 aa  804    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  99.75 
 
 		 398 aa  804    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 		 398 aa  807    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  95.85 
 
 		 399 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  96.11 
 
 		 399 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  95.6 
 
 		 399 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  95.85 
 
 		 399 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  100 
 
 		 398 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  807    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  100 
 
 		 398 aa  807    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  74.61 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  73.3 
 
 		 397 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  72.34 
 
 		 397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  73.18 
 
 		 398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  70.94 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  70.94 
 
 		 406 aa  567  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  70.68 
 
 		 406 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  69.9 
 
 		 398 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  37.53 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  35.9 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  34.66 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  33.67 
 
 		 393 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  32.41 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.49 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  27.34 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.49 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  32.53 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  30.11 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  26.6 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  31.97 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  26.8 
 
 		 393 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  31.97 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  27.99 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  24.79 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  25.46 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  26.95 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  24.87 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  31.35 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  24.66 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  27.08 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  25.38 
 
 		 412 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  30.09 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  22.7 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  30.31 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  29.24 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  25.19 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  28.1 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  28.1 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  27.24 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  29.78 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  29.78 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  30 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.86 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  27.57 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  27.24 
 
 		 412 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  26.88 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  31.25 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  25.89 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  25.19 
 
 		 412 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  30.45 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  25.69 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  24.87 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  25.19 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.84 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  23.58 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  27.91 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  28.73 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  25.63 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  23.68 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  26.64 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  23.34 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  27.8 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2164  HemY domain protein  21.74 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.757442  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0702  HemY, N-terminal:tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 		 1737 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  24.48 
 
 		 492 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1486 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  24.41 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  21.2 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  24.55 
 
 		 482 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2747  HemY-like protein  24.34 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>