47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2911 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  92.53 
 
 		 482 aa  914    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 482 aa  979    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  92.95 
 
 		 482 aa  916    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  58.86 
 
 		 494 aa  548  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  57.17 
 
 		 502 aa  541  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  59.48 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  50.41 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  31.26 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  31.26 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  31.26 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  32.96 
 
 		 588 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  33.51 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  35.9 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  30.93 
 
 		 641 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  35.14 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  30.02 
 
 		 516 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  36.36 
 
 		 528 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  30.22 
 
 		 526 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  33.63 
 
 		 565 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  35.31 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  32.84 
 
 		 561 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  29.18 
 
 		 531 aa  169  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  29.32 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  31.57 
 
 		 583 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  31.17 
 
 		 567 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  31.71 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  30.21 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  27.99 
 
 		 553 aa  160  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  28.22 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  28.22 
 
 		 523 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  29.38 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  29.73 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.52 
 
 		 492 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  27.23 
 
 		 551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.58 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  32.3 
 
 		 515 aa  94.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  25.37 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  26.29 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  21.35 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  24.23 
 
 		 233 aa  52.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  46.51 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  21.37 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 467 aa  43.5  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 464 aa  43.1  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>