45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0259 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  72.43 
 
 		 583 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  100 
 
 		 565 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  66.02 
 
 		 561 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  75.34 
 
 		 588 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  57.75 
 
 		 552 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  51.26 
 
 		 641 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  58.05 
 
 		 555 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  42.63 
 
 		 511 aa  360  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  46.59 
 
 		 511 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  46.82 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  49.28 
 
 		 567 aa  346  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  46.54 
 
 		 536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  48.41 
 
 		 528 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  48.35 
 
 		 507 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  38.98 
 
 		 516 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  38.48 
 
 		 553 aa  296  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  40.83 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  40.83 
 
 		 523 aa  291  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  40.93 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  36.3 
 
 		 526 aa  286  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  36.38 
 
 		 551 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  39 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  36.8 
 
 		 536 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  39 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  37.56 
 
 		 512 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  35.25 
 
 		 531 aa  239  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  30.52 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  30.3 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  30.3 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  31.58 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  29.91 
 
 		 494 aa  171  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  31.89 
 
 		 509 aa  160  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  29 
 
 		 596 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  29.77 
 
 		 433 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  30.5 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  31.03 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  29.84 
 
 		 394 aa  67  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  27.96 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  20.56 
 
 		 416 aa  55.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  19.62 
 
 		 413 aa  51.6  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  23.66 
 
 		 398 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  26.47 
 
 		 391 aa  47.4  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  21.29 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  27.95 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  23.65 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>