37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0121 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  100 
 
 
515 aa  980    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  37.06 
 
 
492 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  37.06 
 
 
511 aa  194  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  37.06 
 
 
511 aa  193  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  36.57 
 
 
511 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  34.16 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  35.52 
 
 
536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  33.41 
 
 
588 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  36.62 
 
 
507 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  31.74 
 
 
641 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  32.7 
 
 
565 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  33.49 
 
 
512 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  30.41 
 
 
494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  34.66 
 
 
567 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  33 
 
 
561 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  36.01 
 
 
528 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  33.49 
 
 
583 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  35.67 
 
 
502 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  31.76 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  32.68 
 
 
544 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  31.62 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  30.86 
 
 
552 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  30.87 
 
 
526 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  31.84 
 
 
493 aa  133  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  35.37 
 
 
596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  31.9 
 
 
482 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  31.9 
 
 
482 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  30.28 
 
 
509 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  32.35 
 
 
536 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  30.32 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  31.52 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  31.04 
 
 
523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  31.59 
 
 
555 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  29.26 
 
 
531 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.67 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  33.66 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  20.43 
 
 
416 aa  47.8  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>