41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4023 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  100 
 
 
544 aa  1066    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  94.85 
 
 
536 aa  919    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  61.95 
 
 
526 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  60.22 
 
 
551 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  53.73 
 
 
533 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  47.74 
 
 
553 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  49.9 
 
 
523 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  49.7 
 
 
523 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  46.26 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  43.43 
 
 
511 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  44.87 
 
 
511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  38.46 
 
 
531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  45.54 
 
 
536 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  43.22 
 
 
567 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  38.9 
 
 
641 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  38.2 
 
 
552 aa  282  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  39.13 
 
 
516 aa  279  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  44.15 
 
 
507 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  38.76 
 
 
565 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  38.84 
 
 
588 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  36.7 
 
 
555 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  41.94 
 
 
528 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  41.86 
 
 
493 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  36.44 
 
 
583 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  37.23 
 
 
561 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  36.71 
 
 
512 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  29.54 
 
 
482 aa  180  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  29.32 
 
 
482 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  29.36 
 
 
482 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  30.23 
 
 
494 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.91 
 
 
492 aa  156  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  30.52 
 
 
596 aa  152  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  27.68 
 
 
502 aa  150  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  28.63 
 
 
509 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  29.92 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  30.85 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  27.65 
 
 
391 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  22.34 
 
 
233 aa  53.5  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  20.3 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  22.6 
 
 
393 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  26.52 
 
 
414 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>