57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2826 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  100 
 
 		 494 aa  994    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  60.18 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  60.39 
 
 		 482 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  58.9 
 
 		 482 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  57 
 
 		 502 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  57.17 
 
 		 596 aa  481  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  51.95 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  32.03 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  32.03 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  31.71 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  35.12 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  33.01 
 
 		 536 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  31.26 
 
 		 588 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  30.34 
 
 		 641 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  32.22 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  30.23 
 
 		 544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  31.29 
 
 		 526 aa  166  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  28.76 
 
 		 516 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  29.77 
 
 		 553 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  29.15 
 
 		 567 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  29.88 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  30.9 
 
 		 552 aa  157  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  30.45 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  32.35 
 
 		 565 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  30.23 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  32.46 
 
 		 561 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  30.39 
 
 		 536 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  30.34 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  30.77 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  28.74 
 
 		 555 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  31.07 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  27.25 
 
 		 531 aa  136  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  30.88 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  27.15 
 
 		 551 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.71 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  30.19 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  27.86 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  23.17 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  22.59 
 
 		 233 aa  53.9  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  22.64 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 767 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  23.74 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  22.34 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 900 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  40.62 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  25.33 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  37.5 
 
 		 466 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  25.5 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3670  cold-shock protein, DNA-binding  24.68 
 
 		 1555 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0651926  decreased coverage  0.00853504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>