41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3702 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  94.3 
 
 
544 aa  939    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  100 
 
 
536 aa  1050    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  61.62 
 
 
551 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  63.06 
 
 
526 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  47.77 
 
 
553 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  53.97 
 
 
533 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  50.4 
 
 
523 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  50.6 
 
 
523 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  45.77 
 
 
511 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  41.85 
 
 
511 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  44.16 
 
 
511 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  45.33 
 
 
536 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  36.83 
 
 
531 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  41.48 
 
 
567 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  38.57 
 
 
641 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  40.09 
 
 
516 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  44.88 
 
 
507 aa  276  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  40.47 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  42.19 
 
 
528 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  39.18 
 
 
493 aa  263  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  40.23 
 
 
565 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  38.6 
 
 
588 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  37.65 
 
 
561 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  37.55 
 
 
555 aa  257  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  35.64 
 
 
583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  37.33 
 
 
512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  29.32 
 
 
482 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  29.2 
 
 
482 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  29.93 
 
 
482 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  31.24 
 
 
492 aa  160  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  30.39 
 
 
494 aa  160  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  28.67 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  30.52 
 
 
596 aa  147  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  28.09 
 
 
509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.77 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  31.68 
 
 
515 aa  94  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  23.35 
 
 
233 aa  58.2  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  26.94 
 
 
391 aa  54.3  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  28.46 
 
 
394 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  18.81 
 
 
413 aa  45.8  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  26.52 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>