54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0565 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  82.59 
 
 		 555 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  100 
 
 		 552 aa  1084    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  67.34 
 
 		 641 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  56.95 
 
 		 588 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  58.27 
 
 		 565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  58.01 
 
 		 561 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  56.36 
 
 		 583 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  50.59 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  44.64 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  49.41 
 
 		 511 aa  381  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  53.18 
 
 		 528 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  49.75 
 
 		 567 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  51.35 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  47.51 
 
 		 536 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  41.51 
 
 		 516 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  44.42 
 
 		 493 aa  290  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  39.31 
 
 		 523 aa  289  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  36.53 
 
 		 553 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  39.31 
 
 		 523 aa  289  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  40.93 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  37.14 
 
 		 526 aa  279  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  38.93 
 
 		 533 aa  276  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  39.08 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  40.47 
 
 		 536 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  39.01 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  35.52 
 
 		 531 aa  247  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  32.2 
 
 		 482 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  32.2 
 
 		 482 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  31.07 
 
 		 482 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  28.89 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  29.61 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  30.86 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  29.82 
 
 		 596 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  31.38 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  28.65 
 
 		 492 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  28.71 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  31.74 
 
 		 394 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  27.59 
 
 		 441 aa  62  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  23.04 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  21.64 
 
 		 413 aa  56.2  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  29.7 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2466  HemY domain-containing protein  29.21 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.618862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  29.52 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  30.34 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  30.34 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  30.34 
 
 		 395 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  30.34 
 
 		 395 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  29.55 
 
 		 395 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>