47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1558 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  100 
 
 		 516 aa  1017    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  49.79 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  43.98 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  47.73 
 
 		 511 aa  363  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  47.73 
 
 		 511 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  48.21 
 
 		 536 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  45.93 
 
 		 507 aa  325  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  48.92 
 
 		 528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  40.47 
 
 		 552 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  41.01 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  45.77 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  42.26 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  41.34 
 
 		 561 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  42.18 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  40.46 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  41.59 
 
 		 551 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  40.43 
 
 		 553 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  44.1 
 
 		 533 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  39.13 
 
 		 544 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  36.98 
 
 		 526 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  40.09 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  39.91 
 
 		 583 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  41.69 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  40.32 
 
 		 523 aa  259  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  40.09 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  31.14 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  31.14 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  30.91 
 
 		 482 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  32.02 
 
 		 531 aa  197  5.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  30.18 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  29.89 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  29 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.16 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  33.09 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  30.09 
 
 		 596 aa  140  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  34.24 
 
 		 515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  30.21 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  22.75 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  20.79 
 
 		 413 aa  57  0.0000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  29.86 
 
 		 393 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  22.48 
 
 		 233 aa  48.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  34.23 
 
 		 388 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  34.23 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  34.23 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  27.4 
 
 		 425 aa  44.3  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  25.52 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  30.63 
 
 		 388 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>