40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0708 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  92.76 
 
 		 511 aa  910    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  100 
 
 		 511 aa  988    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  92.17 
 
 		 511 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  77.16 
 
 		 536 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  71.79 
 
 		 507 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  69.32 
 
 		 528 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  45.17 
 
 		 552 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  48 
 
 		 641 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  47.73 
 
 		 516 aa  359  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  50.6 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  46.82 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  46.59 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  48.47 
 
 		 561 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  41.33 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  45.81 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  45.29 
 
 		 536 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  47.06 
 
 		 555 aa  317  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  44.98 
 
 		 493 aa  315  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  41.28 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  42.65 
 
 		 551 aa  303  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  43.33 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  43.33 
 
 		 523 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  45.65 
 
 		 583 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  42.98 
 
 		 512 aa  292  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  45.71 
 
 		 533 aa  289  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  34.25 
 
 		 531 aa  249  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  31.58 
 
 		 482 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  31.58 
 
 		 482 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  31.26 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  32.5 
 
 		 502 aa  210  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  31.8 
 
 		 494 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  34.45 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  30.68 
 
 		 596 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  30.55 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.09 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  34.83 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  29.94 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  20.55 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  25.54 
 
 		 400 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  35.8 
 
 		 391 aa  53.5  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>