43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3418 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1013    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  56.38 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  56.58 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  55.31 
 
 		 509 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  56.92 
 
 		 482 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  57 
 
 		 494 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  55.65 
 
 		 596 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  35.01 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  35.01 
 
 		 511 aa  219  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  33.87 
 
 		 511 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  33.89 
 
 		 536 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  32.52 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  32.49 
 
 		 588 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  35.25 
 
 		 528 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  30.11 
 
 		 641 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  32.15 
 
 		 567 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  35.45 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  29.71 
 
 		 516 aa  171  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  35.29 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  33.42 
 
 		 561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  30.34 
 
 		 552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  26.9 
 
 		 531 aa  158  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  30 
 
 		 555 aa  153  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  32.95 
 
 		 583 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  29.16 
 
 		 526 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  31.3 
 
 		 493 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  28.4 
 
 		 523 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  29.01 
 
 		 523 aa  149  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  28.44 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  27.9 
 
 		 544 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  32.32 
 
 		 536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  26.01 
 
 		 551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  30.57 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  33.62 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  31.14 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  35.38 
 
 		 515 aa  96.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  22.03 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  28.36 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  25 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  25.88 
 
 		 233 aa  62.4  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  24.5 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  25.83 
 
 		 729 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>