41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1995 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 596 aa  1193    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  60.09 
 
 		 482 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  60.09 
 
 		 482 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  59.08 
 
 		 482 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  56.6 
 
 		 494 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  55.01 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  50.76 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  31.5 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  32.57 
 
 		 511 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  31.91 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  32.07 
 
 		 526 aa  174  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  32.62 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  29.79 
 
 		 641 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  30.96 
 
 		 544 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  32.71 
 
 		 567 aa  161  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  30.59 
 
 		 588 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  30.16 
 
 		 516 aa  160  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  34.36 
 
 		 507 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  28.41 
 
 		 531 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  30.7 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  31.32 
 
 		 512 aa  150  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  33.24 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  30.05 
 
 		 536 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  29.59 
 
 		 565 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  27.4 
 
 		 553 aa  144  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  33.89 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.76 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  32.12 
 
 		 533 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  29.95 
 
 		 583 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  29.59 
 
 		 555 aa  139  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  28.52 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  30.59 
 
 		 561 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  28.02 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  28.22 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  34.8 
 
 		 515 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.56 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  20.5 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  24.89 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  24.41 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  23.71 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  24.88 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>