37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1161 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  100 
 
 
567 aa  1085    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  50.23 
 
 
511 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  49.41 
 
 
552 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  49.31 
 
 
511 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  49.31 
 
 
511 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  45.17 
 
 
641 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  44.62 
 
 
565 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  50.47 
 
 
536 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  43.27 
 
 
555 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  41.67 
 
 
561 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  52.8 
 
 
528 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  39.08 
 
 
588 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  52.09 
 
 
507 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  45.77 
 
 
516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  42.02 
 
 
583 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  39.79 
 
 
553 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  43.22 
 
 
544 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  43.71 
 
 
523 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  43.71 
 
 
523 aa  308  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  37.88 
 
 
536 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  42 
 
 
533 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  38.51 
 
 
526 aa  297  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  36.94 
 
 
551 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  37.61 
 
 
493 aa  263  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  39.1 
 
 
512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  33.26 
 
 
531 aa  219  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  32.5 
 
 
502 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  31.43 
 
 
482 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  31.43 
 
 
482 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  30.46 
 
 
482 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  29.98 
 
 
596 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  36.09 
 
 
492 aa  163  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  27.85 
 
 
494 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  29.76 
 
 
509 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  34.99 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  32.42 
 
 
515 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  28.48 
 
 
412 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>