59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1352 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1016    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  41.07 
 
 		 511 aa  324  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  42.98 
 
 		 511 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  43.02 
 
 		 511 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  41.4 
 
 		 516 aa  293  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  45.08 
 
 		 536 aa  292  8e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  38.89 
 
 		 641 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  43.61 
 
 		 507 aa  280  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  39.5 
 
 		 552 aa  279  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  42.62 
 
 		 528 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  38.44 
 
 		 565 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  39.22 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  38.65 
 
 		 588 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  35.86 
 
 		 561 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  37.97 
 
 		 493 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  39.49 
 
 		 567 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  36.92 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  38.2 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  38.2 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  37.03 
 
 		 551 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  39.82 
 
 		 555 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  34.51 
 
 		 536 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  38.46 
 
 		 583 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  35.2 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  37.1 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  36.39 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  33.11 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  34.54 
 
 		 509 aa  201  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  33.11 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  30.1 
 
 		 531 aa  194  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  33.97 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  32.45 
 
 		 494 aa  180  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  32.73 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  31.71 
 
 		 596 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  32.29 
 
 		 515 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  23.32 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  23.98 
 
 		 416 aa  82  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  27.91 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  22.52 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.17 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  24.3 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  23.7 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  23.95 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  29.44 
 
 		 388 aa  50.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  25.56 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  23.78 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  25 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  25 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  24.06 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  25.2 
 
 		 399 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>