42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0125 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  758    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  27.46 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  27.51 
 
 		 482 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  27.27 
 
 		 482 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  30.79 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  30.79 
 
 		 511 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  32.13 
 
 		 641 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  29.57 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  29.51 
 
 		 552 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  27.37 
 
 		 502 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  27.93 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  29.59 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  29.06 
 
 		 565 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  27.79 
 
 		 509 aa  82  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  29 
 
 		 536 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  27.8 
 
 		 588 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  32.73 
 
 		 507 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  28.7 
 
 		 516 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  32.44 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  27.17 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  29.61 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  29.39 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  28.41 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  27.71 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  24.69 
 
 		 596 aa  56.6  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  23.64 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  28.86 
 
 		 567 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  26.32 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  28.33 
 
 		 544 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  29.26 
 
 		 536 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  26.5 
 
 		 526 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  26.98 
 
 		 492 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  27.73 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  29.27 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>