39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4083 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  100 
 
 
509 aa  1016    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  55.31 
 
 
502 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  52.24 
 
 
482 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  52.04 
 
 
482 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  52.31 
 
 
482 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  51.95 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  51.08 
 
 
596 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  33.86 
 
 
512 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  30.57 
 
 
511 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  31.25 
 
 
511 aa  170  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  30.55 
 
 
511 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  32.05 
 
 
588 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  29.21 
 
 
516 aa  160  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  34.14 
 
 
536 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  29.61 
 
 
641 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  36.45 
 
 
561 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  32.31 
 
 
552 aa  153  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  32.05 
 
 
583 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  30.95 
 
 
567 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  33.88 
 
 
528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  33.93 
 
 
565 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  28.63 
 
 
544 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  31.25 
 
 
493 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  31.14 
 
 
507 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  30.53 
 
 
555 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  28.43 
 
 
526 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  27.29 
 
 
553 aa  133  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  28.21 
 
 
523 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  25.39 
 
 
531 aa  128  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  30.83 
 
 
492 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  28.21 
 
 
523 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  29.54 
 
 
536 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  28.15 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  25.6 
 
 
551 aa  110  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  27.75 
 
 
533 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  33.53 
 
 
515 aa  94  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  27 
 
 
394 aa  60.1  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  24.63 
 
 
412 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2575  TPR domain-containing protein  21.89 
 
 
451 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000631564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>