46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1190 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  986    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  52.33 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  45.07 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  45.43 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  45.89 
 
 		 511 aa  348  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  45.71 
 
 		 536 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  45.01 
 
 		 552 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  45.63 
 
 		 507 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  45.54 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  42.26 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  42.56 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  40.98 
 
 		 544 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  39.39 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  44.19 
 
 		 555 aa  278  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  38.49 
 
 		 536 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  39.19 
 
 		 561 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  38.96 
 
 		 565 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  35.5 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  41.96 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  41.69 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  40.69 
 
 		 523 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  37.47 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  40.46 
 
 		 523 aa  247  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  39.67 
 
 		 583 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  37.07 
 
 		 553 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  32.96 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  30.2 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  29.98 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  28.64 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  30.43 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  28.77 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  31.63 
 
 		 596 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  33.33 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  28.73 
 
 		 509 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  27.89 
 
 		 492 aa  110  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  30.94 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  29.31 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  25.56 
 
 		 425 aa  53.5  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  20.92 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  22.52 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  32.35 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  32.8 
 
 		 396 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  32.35 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  32.35 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  32.35 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  20.15 
 
 		 413 aa  43.5  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>