42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2072 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  69.67 
 
 
511 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  69.55 
 
 
511 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  100 
 
 
536 aa  1011    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  73.01 
 
 
511 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  63.53 
 
 
507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  68.76 
 
 
528 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  47.95 
 
 
516 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  44.06 
 
 
552 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  50.59 
 
 
567 aa  359  9e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  45.41 
 
 
641 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  42.34 
 
 
588 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  43.69 
 
 
561 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  46.67 
 
 
565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  43.53 
 
 
544 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  45.09 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  42.86 
 
 
555 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  41.46 
 
 
536 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  43.42 
 
 
533 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  42.16 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  45.97 
 
 
583 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  43.01 
 
 
523 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  43.01 
 
 
523 aa  291  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  38.9 
 
 
551 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  38.76 
 
 
526 aa  286  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  43.27 
 
 
512 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  35.02 
 
 
531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  33.48 
 
 
482 aa  216  9e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  33.48 
 
 
482 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  33.87 
 
 
482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  32.44 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  32.51 
 
 
494 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  36.2 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  32.8 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  31.96 
 
 
596 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.26 
 
 
492 aa  146  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  32.65 
 
 
515 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  31.53 
 
 
394 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  25.94 
 
 
400 aa  54.7  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  21.22 
 
 
413 aa  52.8  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  29.63 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  21.5 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  33.33 
 
 
635 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>