43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4536 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 528 aa  999    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  79.38 
 
 		 507 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  63 
 
 		 511 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  66.74 
 
 		 511 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  63.62 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  68.76 
 
 		 536 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  46.99 
 
 		 552 aa  387  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  51.29 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  52.8 
 
 		 567 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  48.62 
 
 		 516 aa  350  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  49.41 
 
 		 565 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  46.11 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  44.8 
 
 		 561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  46.62 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  45.39 
 
 		 493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  41.55 
 
 		 553 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  42.86 
 
 		 523 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  42.86 
 
 		 523 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  47.76 
 
 		 583 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  39.2 
 
 		 551 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  41.19 
 
 		 526 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  45.71 
 
 		 533 aa  289  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  41.61 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  40.28 
 
 		 536 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  41.77 
 
 		 512 aa  273  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  35.93 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  34.55 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  34.55 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  32.88 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  32.75 
 
 		 502 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  32.35 
 
 		 494 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  30.77 
 
 		 509 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  35.09 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  34.36 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  31.05 
 
 		 596 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  36.2 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  32.54 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  25.62 
 
 		 400 aa  50.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  28.31 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  21.08 
 
 		 233 aa  47.8  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.36 
 
 		 635 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 616 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 923 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>