41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2969 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 551 aa  1084    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  58.7 
 
 		 526 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  60.04 
 
 		 544 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  61.62 
 
 		 536 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  46.88 
 
 		 553 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  53.05 
 
 		 533 aa  422  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  50.8 
 
 		 523 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  50.8 
 
 		 523 aa  412  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  41.65 
 
 		 511 aa  300  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  38.87 
 
 		 511 aa  299  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  42.42 
 
 		 511 aa  297  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  36.82 
 
 		 531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  41 
 
 		 516 aa  280  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  42.72 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  36.26 
 
 		 641 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  38.8 
 
 		 552 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  38.88 
 
 		 567 aa  257  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  41.16 
 
 		 493 aa  256  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  41.09 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  39.9 
 
 		 528 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  35.52 
 
 		 561 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  36.04 
 
 		 555 aa  251  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  34.52 
 
 		 588 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  35.64 
 
 		 565 aa  250  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  34.02 
 
 		 583 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  35.54 
 
 		 512 aa  223  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  27.72 
 
 		 482 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  27.52 
 
 		 482 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  27.49 
 
 		 482 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  25.38 
 
 		 502 aa  140  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  30.5 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  26.7 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  31.58 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  27.05 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  25.25 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  31.51 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  25.98 
 
 		 391 aa  55.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  21.05 
 
 		 416 aa  52.8  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  21.75 
 
 		 413 aa  50.4  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  24.41 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  21.76 
 
 		 233 aa  47.4  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>