46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1508 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  92.53 
 
 		 482 aa  890    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  99.38 
 
 		 482 aa  971    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  975    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  60.18 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  56.58 
 
 		 502 aa  544  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  60.09 
 
 		 596 aa  498  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  52.24 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  31.58 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  31.12 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  31.35 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  31.07 
 
 		 641 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  34.97 
 
 		 552 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  32.27 
 
 		 588 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  35.9 
 
 		 536 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  35.99 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  37.85 
 
 		 528 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  29.8 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  30.83 
 
 		 526 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  33.04 
 
 		 565 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  30.91 
 
 		 567 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  28.6 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  28.81 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  34.77 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  31.35 
 
 		 555 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  31.34 
 
 		 583 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  31.88 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  32.55 
 
 		 561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  27.66 
 
 		 531 aa  160  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  28.67 
 
 		 523 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  28.67 
 
 		 523 aa  156  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  29.38 
 
 		 536 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  29.59 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  27.27 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  33.88 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.58 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  31.68 
 
 		 515 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  23.97 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  26.9 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  22.87 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  23.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  40.98 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  46.88 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  42.42 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  42.22 
 
 		 464 aa  43.5  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>