46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0043 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  100 
 
 		 492 aa  966    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  36.02 
 
 		 515 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  31.62 
 
 		 511 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  34.16 
 
 		 511 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  31.57 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  32.16 
 
 		 516 aa  169  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  36.48 
 
 		 567 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  35.68 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  33.09 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  32 
 
 		 641 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  34.6 
 
 		 544 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  34.51 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  34.62 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  34.62 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  31.67 
 
 		 502 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  34.06 
 
 		 536 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  31.53 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  34.99 
 
 		 528 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  28.96 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  31.24 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  29.53 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  34.47 
 
 		 494 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  30.83 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  30.5 
 
 		 551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  32.1 
 
 		 596 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  28.92 
 
 		 561 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  30.5 
 
 		 565 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  28.44 
 
 		 552 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  31.18 
 
 		 523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  31.18 
 
 		 523 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  32 
 
 		 583 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  29.65 
 
 		 555 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  32.66 
 
 		 533 aa  133  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  25.48 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  29.29 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  27.97 
 
 		 493 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  26.88 
 
 		 233 aa  47  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  25.78 
 
 		 398 aa  43.1  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  27.48 
 
 		 398 aa  43.5  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>