43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4470 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  100 
 
 		 507 aa  979    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  79.04 
 
 		 528 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  66.33 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  67.71 
 
 		 511 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  71.33 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  70.7 
 
 		 536 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  47.43 
 
 		 641 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  51.53 
 
 		 552 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  48.72 
 
 		 516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  51.82 
 
 		 567 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  48.31 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  48.99 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  44.22 
 
 		 588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  45.85 
 
 		 561 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  43 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  45.89 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  40.44 
 
 		 551 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  44.99 
 
 		 583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  40.39 
 
 		 526 aa  310  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  43.89 
 
 		 523 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  43.89 
 
 		 523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  43.36 
 
 		 544 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  45.8 
 
 		 533 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  43.56 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  42.24 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  35.57 
 
 		 531 aa  261  3e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  35.06 
 
 		 482 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  35.06 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  34.31 
 
 		 482 aa  223  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  33.18 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  32.73 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  34.22 
 
 		 433 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  31.66 
 
 		 492 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  29.9 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  31.05 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  37.08 
 
 		 515 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0125  HemY domain-containing protein  33.23 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  19.95 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  20.05 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  26.43 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  30 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.4 
 
 		 807 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  22.91 
 
 		 400 aa  43.9  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>