60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3199 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  100 
 
 		 533 aa  1044    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  53.05 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  53.39 
 
 		 544 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  53.12 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  53.97 
 
 		 536 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  50.92 
 
 		 526 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  55.62 
 
 		 523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  55.82 
 
 		 523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  41.88 
 
 		 511 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  45.48 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  45.71 
 
 		 511 aa  339  7e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  45.31 
 
 		 567 aa  332  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  43.92 
 
 		 516 aa  329  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  35.53 
 
 		 531 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  38.93 
 
 		 552 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  39.63 
 
 		 641 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  47.12 
 
 		 536 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  38.63 
 
 		 555 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  46.42 
 
 		 507 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  46.02 
 
 		 528 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  42.09 
 
 		 565 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  36.28 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  38.88 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  41.74 
 
 		 493 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  38.43 
 
 		 561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  39.73 
 
 		 512 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  30.89 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  30.44 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  30.67 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  31.89 
 
 		 596 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  31.29 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  28.02 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  32.66 
 
 		 492 aa  160  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  28.08 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  30.05 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  33.16 
 
 		 515 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  24.86 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  19.55 
 
 		 413 aa  56.6  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  25.78 
 
 		 425 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.28 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  24.57 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  24.57 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.4 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1232  hypothetical protein  22.44 
 
 		 233 aa  48.5  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.543948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  24.57 
 
 		 406 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  23.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 		 403 aa  47.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  21.5 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  18.94 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  21 
 
 		 398 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  23.7 
 
 		 398 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 329 aa  43.9  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>