42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4148 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4148  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1048    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2969  HemY domain-containing protein  58.7 
 
 		 551 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4023  HemY domain protein  61.65 
 
 		 544 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412219  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3702  HemY domain protein  63.06 
 
 		 536 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0978  HemY domain-containing protein  47.66 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.784946  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1812  hypothetical protein  53.56 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3199  HemY-like  50.92 
 
 		 533 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1884  hypothetical protein  53.33 
 
 		 523 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0749  HemY domain protein  41.01 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0735  HemY domain-containing protein  43.48 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.638898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  41.94 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0259  HemY domain protein  37.42 
 
 		 565 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0209442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0565  HemY-like  37.14 
 
 		 552 aa  278  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.819773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1161  HemY domain-containing protein  40.78 
 
 		 567 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4470  HemY domain protein  43.87 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.918979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1558  HemY domain protein  39.03 
 
 		 516 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0467  HemY-like  35.12 
 
 		 588 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.270683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4536  HemY domain-containing protein  42.18 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.824445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0064  hypothetical protein  34.97 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0286  HemY domain-containing protein  36.14 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2072  HemY domain-containing protein  41.35 
 
 		 536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0049  HemY-like  34.49 
 
 		 561 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0312  HemY-like  36.73 
 
 		 583 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0474  HemY protein  36.01 
 
 		 555 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1190  HemY domain-containing protein  35.88 
 
 		 493 aa  243  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300714  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1352  HemY domain-containing protein  35.28 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2911  HemY domain-containing protein  30.44 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  0.116649 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0158  HemY domain-containing protein  31.58 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0856182  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1508  hypothetical protein  31.38 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2826  HemY-like  31.22 
 
 		 494 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3418  hypothetical protein  29.05 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1995  HemY domain-containing protein  32.12 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0043  HemY domain-containing protein  28.96 
 
 		 492 aa  150  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4083  HemY-like  28.43 
 
 		 509 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571415  normal  0.408221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3566  HemY-like  29.15 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0954904  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0121  HemY domain-containing protein  31.84 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  23.37 
 
 		 425 aa  51.6  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0080  hypothetical protein  20.1 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.628887  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  26.76 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0129  HemY domain-containing protein  18.4 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  26.19 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  27.68 
 
 		 393 aa  43.5  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>