77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0339 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  100 
 
 		 393 aa  795    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  42.09 
 
 		 391 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  28.35 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  26.8 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  25.77 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  24.81 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  25.13 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  26.26 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  26.96 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  26.02 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  26.02 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  26.02 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  25.45 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  25.07 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  25.6 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  25.6 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  25.6 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  25.6 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  24.09 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  25.6 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  25.94 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  23.83 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  25 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  26.37 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  24.23 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  26.79 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  26.67 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  26.39 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  25.38 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  24.11 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  23.97 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  26.13 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  23.86 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  24.35 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  27.99 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  26.97 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  20.96 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  27.08 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  21.48 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  25.06 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  23.12 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  22.02 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  23.08 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  21.45 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  24.61 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  24.61 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  24.59 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  24.35 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  21.76 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  22.4 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  21.76 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  25.65 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  23.66 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  23.72 
 
 		 392 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  26.42 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  25.24 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  23.72 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  24.11 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  23.28 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  22.1 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  25.33 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04231  porphyrin biosynthesis protein  24.93 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  24.8 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  27.34 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  25.07 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  24.8 
 
 		 412 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  24.52 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  23.18 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  23.18 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>