95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0385 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  100 
 
 		 396 aa  801    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  52.45 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  50.91 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  50.91 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  50.26 
 
 		 388 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  49.61 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  50.13 
 
 		 388 aa  358  7e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0383  HemY domain-containing protein  49.87 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0385  HemY domain-containing protein  49.87 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4097  HemY domain-containing protein  50.54 
 
 		 388 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.912703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  47.41 
 
 		 389 aa  345  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3590  HemY domain-containing protein  48.39 
 
 		 388 aa  334  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  44.3 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4136  HemY domain-containing protein  43.15 
 
 		 389 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3257  HemY protein  43.56 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.306147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  42.86 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  25.13 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  27.21 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  26.56 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  24.94 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  25.56 
 
 		 398 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  25 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3062  hemY protein, putative  25 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  24.06 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  23.1 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  24.58 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  22.37 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  23.97 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  23.97 
 
 		 395 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  21.77 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  25.63 
 
 		 425 aa  93.2  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  23.99 
 
 		 398 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  24.76 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  23.38 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2177  HemY  25.95 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2204  hemY protein  25.95 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.103218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  23.12 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  22.07 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  22.07 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  22.07 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0505  HemY-like  27.11 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  23.06 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  23.06 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  23.06 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3594  HemY domain-containing protein  27.34 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3106  HemY-like protein  26.26 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.417009  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  23.06 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  23.06 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0026  HemY-like protein  25.54 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0189  HemY domain protein  26.06 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5484  HemY-like  24.49 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0214  HemY domain-containing protein  26.6 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0211  HemY domain-containing protein  26.06 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6003  HemY protein  25.67 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364939  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0115  HemY-like  24.17 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2687  HemY-like  25.32 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0259  HemY domain-containing protein  27.13 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0131  hemY protein, putative  25 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  22.9 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2667  HemY domain-containing protein  24.12 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000205656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47570  HemY-like protein  23.91 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.825409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69420  putative enzyme of heme biosynthesis  25.96 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  24.47 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2177  HemY domain-containing protein  25.31 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.000141397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0059  HemY, N-terminal  24.68 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3409  hypothetical protein  25.25 
 
 		 396 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0484  HemY domain-containing protein  23.08 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1071  HemY domain protein  25 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.62835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0032  HemY-like protein  24.94 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0283  HemY domain-containing protein  24.82 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2164  HemY domain protein  23.37 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2569  HemY domain protein  22.93 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.538959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2427  HemY domain-containing protein  23.1 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399788  normal  0.263655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2423  HemY domain-containing protein  23.1 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0160079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1811  HemY-like  23.1 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3003  hypothetical protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1074  HemY protein N-terminus family protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0732  hypothetical protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1080  putative hemY protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2281  hypothetical protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1232  putative porphyrin biosynthesis related protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1594  hypothetical protein  22.25 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0874  HemY protein N-terminus family protein  22.39 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  23.12 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0871  HemY domain-containing protein  22.9 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5750  HemY-like protein  23.41 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0708  HemY domain protein  27.33 
 
 		 511 aa  43.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.408279  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3671  HemY, N-terminal  20.87 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>