More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1189 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  87.75 
 
 		 466 aa  835    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  78.14 
 
 		 467 aa  722    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  78.14 
 
 		 467 aa  721    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 466 aa  939    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  74.62 
 
 		 457 aa  689    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  98.71 
 
 		 466 aa  931    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  87.31 
 
 		 467 aa  842    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0985  DNA repair protein RadA  76.03 
 
 		 462 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  78.6 
 
 		 464 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2291  DNA repair protein RadA  67.69 
 
 		 482 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.284518  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2015  DNA repair protein RadA  67.76 
 
 		 486 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.086129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2454  DNA repair protein RadA  68.27 
 
 		 483 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.819464  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2284  DNA repair protein RadA  67.61 
 
 		 503 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2995  DNA repair protein RadA  68.35 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3499  DNA repair protein RadA  66.45 
 
 		 485 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3789  DNA repair protein RadA  66.03 
 
 		 499 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2597  DNA repair protein RadA  67.03 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3897  DNA repair protein RadA  69.35 
 
 		 478 aa  591  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4631  DNA repair protein RadA  68.48 
 
 		 477 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.742671  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  67.39 
 
 		 481 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  69.35 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  69.12 
 
 		 476 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  63.28 
 
 		 474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2309  DNA repair protein RadA  67.52 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0415  DNA repair protein RadA  66.28 
 
 		 470 aa  559  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.563871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2402  DNA repair protein RadA  67.11 
 
 		 489 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1712  DNA repair protein RadA  61 
 
 		 455 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.136365  normal  0.743682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  60.17 
 
 		 455 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1064  DNA repair protein RadA  61 
 
 		 452 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.66544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 452 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  61.22 
 
 		 452 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  58.98 
 
 		 453 aa  525  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  62.15 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1207  DNA repair protein RadA  61.66 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0406  DNA repair protein RadA  59.35 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3941  DNA repair protein RadA  62.94 
 
 		 454 aa  497  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  58.59 
 
 		 460 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  58.08 
 
 		 455 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  57.24 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0403  DNA repair protein RadA  56.25 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1850  DNA repair protein RadA  57.86 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0305  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  52.8 
 
 		 450 aa  457  1e-127  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0698  DNA repair protein RadA  49.41 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  49.78 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 		 454 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  50.88 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  52.37 
 
 		 484 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.12 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  51.39 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 450 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  51.6 
 
 		 453 aa  428  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  51.87 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  49.31 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  52.17 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  47.74 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  49.1 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  45.12 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.96 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  50.34 
 
 		 455 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50.43 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  50.8 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  51.28 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  51.41 
 
 		 451 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  51.62 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0646  DNA repair protein RadA  50.92 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  50.23 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  50.59 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0731  DNA repair protein RadA  50.92 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 458 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  50.68 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60990  DNA repair protein RadA  50.68 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  49.2 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.05 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  50.58 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  48.86 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  46.79 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  46.48 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49.2 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  48.86 
 
 		 451 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  50.12 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  48.6 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  49.53 
 
 		 448 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  48.97 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  45.67 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  43.89 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  49.3 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  48.28 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>